《天降之物》剧场版2中，伊卡洛斯最后“自杀”的原因是为了保护智树，确保他能安全到达西纳普斯。具体原因如下：
地球面临毁灭：由于学长被人利用，在石碑上写下了创造新世界的意愿，导致地球开始毁灭。
伊卡洛斯的决定：为了保护智树，伊卡洛斯决定带着他飞向西纳普斯，因为在那里他们可以逃脱地球的毁灭。
伊卡洛斯的程序限制：然而，伊卡洛斯的身体中有一个程序，即如果未经同意就擅自行动，她自己将会死去。在带着智树飞往西纳普斯的过程中，这一程序被触发。
伊卡洛斯的牺牲：当伊卡洛斯把智树送到神殿时，由于程序的限制，她选择了牺牲自己。在死前，她吻了智树，并说出了“我爱你”，这也标志着她学会了笑，展现了人类般的情感。
智树的行动与复活：智树在西纳普斯与空之城主对决并打败了他。之后，他来到石碑前写下“让一切回复原样”，最终大家都复活了，包括伊卡洛斯。
综上所述，伊卡洛斯的“自杀”行为实际上是一种牺牲，她为了保护智树并确保他能安全到达西纳普斯，不惜牺牲自己的生命。而智树最终也通过自己的努力，让大家重新获得了生命。
