《怪医黑杰克》有续集，其续集形式多样，涵盖AI续作、OVA动画续篇、漫画续篇以及2005年动画续作等不同类型。
AI续作：手冢治虫的长子将父亲的大量作品投喂给AI，借助AI技术出版了《怪医黑杰克》的续作并售卖。在这类续作中，剧情以及人物设定全部由AI完成，漫画家仅对图画进行监修。这种创作方式融合了现代科技与传统漫画元素，为经典作品带来了新的呈现形式，不过由于是AI创作，在剧情逻辑和人物塑造的深度上可能与原作存在一定差异。
OVA动画续篇：《怪医黑杰克 FINAL》是OVA动画形式的续篇。它由日本动画导演桑原智执导，Tezuka Productions制作，于2011年12月以DVD形式发行。此作品是1993年至2000年《怪医黑杰克》OVA系列的延续，在画面制作和剧情编排上延续了OVA系列的一贯风格，为观众带来了熟悉的观影体验，进一步丰富了黑杰克的故事世界。
漫画续篇：《怪医黑杰克Final》作为漫画续篇，由手冢治虫创作。它延续了《怪医黑杰克》的故事线，将故事置于新的历史背景下，让黑杰克展开新的冒险和挑战。这部续篇漫画在保留原作核心元素的基础上，融入了新的时代背景和情节设定，为读者呈现出一个既熟悉又新颖的黑杰克故事。
2005年动画续作：2005年推出的续作Black Jack21，共21集。其画风更接近现代动画，在视觉效果上更加符合当代观众的审美需求。该续作在剧情上继续围绕黑杰克的医学冒险展开，通过一个个精彩的病例和故事，展现了黑杰克高超的医术和独特的性格魅力。
