珊瑚虫分泌的骨骼主要成分为文石型碳酸钙（化学式CaCO₃），同时含有少量有机质基质及微量镁、锶、铁等金属元素。珊瑚虫的骨骼为钙质外骨骼，造礁珊瑚的群体骨骼共同构成了珊瑚礁的主体：1. 文石型碳酸钙是骨骼的核心组成部分，占总成分的95%以上，相比方解石型碳酸钙，文石的晶体结构更适合形成坚固的群体骨骼。2. 有机质作为矿化模板：珊瑚虫会先分泌胶原蛋白、酸性多糖等有机质框架，为碳酸钙沉积提供附着位点，调控骨骼的生长形态，这类有机质约占骨骼总质量的1%-5%。3. 微量金属元素会因生存环境、珊瑚种类不同存在差异，比如红珊瑚因骨骼中富集铁元素，呈现出标志性的红色。
