中华人民共和国新闻出版总署的机构设置主要包括以下核心部门及直属机构：
核心部门： 办公厅：负责总署的日常行政管理工作。 财务司：管理总署的财务预算和审计，确保资金有效利用。 法规司：制定并监督执行新闻出版法规，维护新闻出版行业的秩序。 出版产业发展司：推动出版业的创新发展和市场拓展。 出版管理司：负责出版物的审核和监管工作。 印刷发行管理司：关注印刷技术和发行渠道的管理，确保出版物的顺利流通。 科技与数字出版司：推进科技在出版业的应用，包括数字出版内容的监管。 反非法和违禁出版物司：打击非法出版行为，维护版权法的权威。 版权管理司：保护知识产权，提供版权服务和法律援助。 对外交流与合作司：加强国际新闻出版领域的交流与合作，提升我国新闻出版业的国际影响力。 人事司：负责总署员工的招聘、培训和人事管理工作。 机关党委：关注总署的党的建设和精神文明工作，确保总署工作的正确方向。 离退休干部工作办公室：照顾和支持总署的退休人员，确保他们的生活质量。 纪检组监察局：负责总署的内部监督与廉政建设工作，确保总署工作的廉洁高效。
直属机构： 人民出版社：出版各类书籍，包括经典著作和政策文献，满足广大读者的阅读需求。 中国新闻出版研究院：进行新闻出版研究，提供专业培训和出版物信息服务，提升新闻出版业的整体水平。 新闻出版报社：发行《新闻出版报》和《中国出版》，报道新闻出版行业的最新动态，为行业内外人士提供信息交流平台。 信息中心：为新闻出版业提供信息服务，监测互联网出版内容，确保信息的准确性和安全性。 版权保护中心：保护知识产权，提供版权登记、代理等服务，维护创作者的合法权益。 教育培训中心：负责总署职工的培训和继续教育，以及职称评审等工作，提升总署的人才队伍素质。 机关服务局：提供总署机关的后勤服务，包括办公与生活支持，确保总署工作的顺利进行。 中国版本图书馆：保管版本资料，促进社会文化发展，为学术研究提供宝贵资源。 质量监督检测中心：对出版物进行质量检测和内容审读，确保出版物的质量符合国家标准。 国家出版基金管理规划办公室：规划和管理国家出版基金，支持出版业的发展和创新。 中国印刷博物馆：传承印刷文化，收藏和研究印刷文物，为公众提供文化教育和休闲场所。
