《变形金刚4：绝迹重生》的剧情讲述了芝加哥大战后地球人对变形金刚失去信任，人类组建墓风部队猎杀变形金刚，而新危机随着人造金刚和惊破天的出现再度降临的故事。具体如下：
芝加哥大战后的信任危机：在惨烈的芝加哥大战中，汽车人成功击退了霸天虎的入侵，但这场战斗造成了巨大的破坏和人员伤亡，导致地球人对变形金刚的态度发生彻底转变。人类不再将汽车人视为盟友，而是对他们产生了深深的恐惧和怀疑，认为他们同样是威胁地球安全的危险存在。
墓风部队的无差别猎杀：美国中情局组建了名为“墓风部队”的特殊组织，其任务是对所有变形金刚进行无差别猎杀，无论他们是汽车人还是霸天虎。这一行动使得汽车人和霸天虎都不得不隐藏自己的行踪，在地球上销声匿迹，以躲避人类的追杀。
凯德·伊格发现擎天柱：居住在得州的落魄机械发明家凯德·伊格在一次偶然的机会中，买回了一辆破旧的卡车车头。他并不知道，这辆看似普通的卡车车头实际上是处在休眠状态的汽车人首领擎天柱。擎天柱选择隐藏在凯德家中，是为了躲避墓风部队的追捕，同时等待时机重新集结汽车人，应对即将到来的危机。
人类科学家的人造金刚计划：一些疯狂的人类科学家从变形金刚的残骸中研究出了他们变形的秘密，并企图利用这一技术制造出人造金刚。他们认为，通过控制人造金刚，人类可以掌握强大的力量，从而摆脱对变形金刚的依赖，甚至成为地球的主宰。
惊破天的出现与新危机：在这些人造金刚中，脱胎自威震天的惊破天成为了人类科学家的得意作品。然而，他们没有想到的是，惊破天并没有真正被人类控制，他保留了威震天的邪恶意志和强大力量。惊破天的出现标志着新一轮危机的卷土重来，他不仅成为了汽车人的强大敌人，也给地球带来了更大的灾难。
汽车人与人类的再次合作：面对惊破天和人造金刚的威胁，擎天柱意识到仅凭汽车人的力量难以应对这场危机。他决定与凯德·伊格一家以及其他人类盟友合作，共同对抗敌人。在这个过程中，汽车人不仅要与惊破天和人造金刚战斗，还要应对墓风部队的追捕和干扰。
最终决战与地球的未来：在一系列激烈的战斗和冒险之后，汽车人和人类盟友终于找到了惊破天的弱点，并成功将其击败。同时，他们也揭露了人类科学家中一些人的阴谋，阻止了人造金刚技术的滥用。最终，地球暂时摆脱了危机，但擎天柱深知，宇宙中仍然存在着许多未知的威胁，汽车人和人类需要继续保持警惕，共同守护地球的和平与安全。
