《熊出没》的女主角主要有赵琳和纳雅。
赵琳是《熊出没之探险日记》系列首位常驻人类女主。她是个古灵精怪的少女，为了寻找童年玩伴东北虎“虎妞”来到狗熊岭，与熊大熊二、光头强组成了探险小队。赵琳勇敢且智慧，擅长用日记记录探险知识，在动画中是推动剧情的关键角色，后来还成为了保护区义工。
纳雅是《熊出没之奇幻空间》的电影版女主，她是鹿族少女，也是金鹿角守护者。生活在奇幻森林的她，身手矫健，还能与自然交流。在电影里，她帮助熊强对抗夺宝军团，守护森林与金鹿角，是系列中充满神秘感的“森女”形象。
除了她们之外，电影《熊出没·原始时代》的阿蓝姐，作为原始部落首领，也是重要女性角色；《熊出没之夺宝熊兵》中的嘟嘟，这个孤儿宝宝同样在剧情里有着重要作用。不过，赵琳和纳雅是《熊出没》系列中最具代表性的女主角。
