神舟二十一号载人飞行任务的具体计划安排可分为发射前、在轨初期、在轨中期及后续驻留阶段，相关信息基于公开任务规划整理。1. 发射前阶段：2025年10月24日，神舟二十一号载人飞船与长征二号F遥二十一运载火箭组合体转运至发射区，后续将开展发射前各项功能检查、联合测试等工作，之后择机发射。2. 在轨初期：2025年12月9日18时45分，乘组将开展约8小时的出舱活动，完成神舟二十号飞船返回舱舷窗巡检拍照、空间站空间碎片防护装置安装、温控适配器多层罩更换等任务。任务期间还将实施人员和应用载荷出舱活动，开展科学实验与技术试验，并视情对神舟二十号飞船受损舷窗进行防护处置。3. 在轨中期 （1）空间科学实验：开展“药代动力学”项目所需唾液样本采集；进行空间流体存储、输运等相关实验；完成燃烧科学实验柜内实验插件中的采样盖更换，无容器柜实验腔体样品清理、轴心机构电极维护，以及实验柜样品更换和设备维护等工作。 （2）应急演练：开展全系统压力应急演练，模拟空间站内部失压时的紧急处置全流程。 （3）站内环境维护：进行舱内空气洁净度测试、声环境监测；检查维护饮水分配器、再生生保系统设备；定期整理舱内物资、转移存放废弃物。 （4）健康保障：开展腹部、心脏及肌肉超声检查、骨密度测量、最大等长肌力测试、听力测试等医学检查，借助“太空跑台”等设备锻炼。 （5）其他任务：利用脑电采集设备、虚拟现实眼镜等进行在轨脑电测试研究；完成执行功能训练、应急决策能力评估和在轨情绪状态测试。4. 后续驻留与准备：乘组计划在轨驻留七个月，截至2026年5月3日已在轨驻留满六个月。后续三名航天员将使用遥操作交会对接系统开展交会对接在轨训练，为天舟十号和神舟二十三号的到来做准备。
