第九人民医院位于上海市黄浦区制造局路639号，2014年11月与第三人民医院合并后 ，改称第九人民医院南院 ( 三院同时改称九院北院 )。根据你问题的描述，估计应该是去九院南院。
崇明岛很大，是中国第三大岛，位于上海市区北面的长江入海口北侧。全岛东西长76公里。
由于你没有具体说明从崇明岛上什么地方出发，这就有些为难回答问题的人了。
下面只能大体上分为，分别从崇明岛西部和东部出发去九院，来制定各自的出行方案。
从崇明岛的西部或东部出发去九院南院，推荐公交车换乘地铁，换乘地点是位于浦东新区的五洲大道地铁站。
两者之间的区别在于乘坐公交车的上车地点不一样，而换乘地铁这一段则是完全一样的。
请接下去看下面的回答内容。
(一)、从崇明岛西部出发
推荐去南门水陆换乘中心，乘坐“申崇六线”公交车去“五洲大道”地铁站。见下面4张截图所示。
(二)、从崇明岛东部出发
推荐去堡镇汽车站 ，乘坐“申崇六线 B线”公交车去“五洲大道”地铁站。见下面4张截图所示。
接下来是换乘地铁方案 ( 五洲大道站乘坐6号线，到世纪大道站换乘4号线内圈 )：
乘坐公交车到达“五洲大道”地铁站下车后，换乘地铁6号线 ( 开往东方体育中心方向 ) ，11站路，到“世纪大道”地铁站下车；
在“世纪大道”地铁站，同站换乘地铁4号线内圈 ( 4号线内圈的下一站是“浦电路”站。4号线分内圈和外圈，别乘错方向，上车之前可以查看一下地铁站台上方的方向标识提示牌。去九院不要乘坐4号线外圈，由于4号线是环线，虽然乘坐外圈也能到西藏南路地铁站，但会白白浪费40分钟左右的时间 ) ，5站路，到“西藏南路”地铁站下车，从4号口出站，步行去九院。见下面5张截图所示。
备注：
从九院出发返回崇明岛，出行的顺序和从崇明岛来九院的时候正好相反。这里就不再详述了。
